Le patogenesi vengono raccolte e descritte nella Materia medica omeopatica e sono nella maggior parte dei casi un riepilogo delle esperienze relative agli effetti tossici, delle sperimentazioni dei rimedi e dei risultati di applicazioni pratiche sui pazienti. Ci sono anche molti rimedi che pur non disponendo di un'approfondita patogenesi si sono ottimamente affermate in pratica in un determinato campo d'applicazione. In questi casi si parla di comprovate applicazioni empiriche del farmaco omeopatico.
